幾十年來，已有大量的研究證明，牲畜在飼養過程中會排放大量溫室氣體。以畜牧業為代表，相關食品及其產業鏈已經成為了影響全球環境的噩夢，對生態系統的影響相當廣泛。

此前，據聯合國糧農組織和世界資源研究所統計，包含養牛在內的畜牧業，所產生的碳排放約占全球總排放量的近 15%;而全部交通工具產生的二氧化碳量不過占 24%。2018 年，Science 雜志曾發表過一篇報告，稱食物及相關產業鏈 “貢獻” 了全球 26% 的溫室氣體排放。

為了有效降低食品碳足跡，并實現可持續發展的食品制造技術。來自哈佛大學 Wyss 研究所的科學家們開始了新的嘗試。他們利用微生物發酵建立更加環保的食品制造工藝。該技術將利用二氧化碳作為發酵原料生產各類生物制品，其首個產品目標將是用二氧化碳合成食用級脂肪。食用脂肪是人可直接食用或烹調的油脂，比如豆油、花生油、橄欖油、羊油、奶油等等。

精確發酵技術為食品增添 “風味”

在 “碳循環”、“碳固定” 技術日新月異的今天，諸如 LanzaTech、Cemvita、Carbon Recycling International 等公司早已將 “氣體發酵” 標簽送上熱搜。

長期以來，受到面包、啤酒制作等傳統發酵工藝的啟發，利用各類微生物快速、有效地進行大規模生物質合成已經是老生常談的話題。

近年來，搭乘越飛越高的合成生物學航班，使用各種經過改造的微生物作為 “細胞工廠” 的精確發酵產業正在逐漸興起。已有越來越多的生物科技公司涌入該領域，以解決畜牧業、養殖業的碳排放問題為首要目標，該類公司制造產品以蛋白質、脂肪為主，在應用端則涉及到人造肉類、乳業及相關的調味品等。

如果蛋白質是制作食品的基礎原料，那么脂肪則為食物增添 “風味”。具體到合成脂肪相關領域，除了微生物發酵技術正在辛勤勞作之外，包括 Hoxton Farms 等基于細胞合成法制造脂肪和肉類的合成生物學公司也在瓜分合成脂肪領域的蛋糕。

(來源：生輝整理)

目前，這些初創公司逐漸開始獲得投資市場的關注。其中，奶酪商人 Change foods 的總融資額達到了 310 萬美元，而關注植物性脂肪的 Nourish Ingredients 則獲得了總計 1440 萬美元的融資。

當前情況下，無論是使用發酵微生物還是培養細胞，各種商用工程微生物的制造過程普遍需要添加淀粉、糖或纖維素作為食物來源以便生產乙醇或乳酸，繼而進行后續的合成反應。

雖然朝著正確的方向邁出了一步，但基于糖類的發酵技術又將為種植業帶來壓力，在全球范圍內并不具有普適性。總的來說，這些公司并沒有打通反應鏈條的上游。

具備個性化生產功能的共生菌群

今年 5 月，分拆自 Wyss 研究所的 Circe Bioscience Inc.(以下簡稱 Circe)在特拉華州注冊成立，該公司的首個目標將是使用工程微生物將二氧化碳轉化為食品級脂肪。

這家初創企業源自于 Wyss 研究所的 Circe 項目，意為 “細胞工廠的循環產業”。兩名來自于哈佛大學 Wyss 研究所的科學家 Shannon Nangle 和 Marika Ziesack 成為了共同創始人。

在她們的項目中，鉤蟲貪銅菌 Cupriavidus necator(以下簡稱 C. necator，此前稱作 Ralstonia eutropha)成為了打通生產鏈條的 “合成密碼”。

大約 60 年前，該類別的典型菌種 C. necator H16 自土壤中被分離出來。自那之后， 它就成為了研究最多、基因組特征最好的化能自養菌。在過去的幾十年中，C. necator 已經以合成聚羥基鏈烷酸酯(PHA，Poly-hydroxyalkanoates)項目成為了熱門研究對象。

與植物類似，該類細菌基于卡爾文循環途徑固碳，其能夠利用氫氣作為電子供體，將二氧化碳還原為有機物。近年來，該細菌作為固碳平臺 “潛力股”，受到了研究人員的青睞。

2020 年，Circe 項目組基于改造的 C. necator 和大腸桿菌等設計了“共生菌群”培養模式，通過固定二氧化碳生產出三種主要產品：蔗糖，PHA 和脂殼聚寡糖(LCOs，lipochitooligosaccharides)。

以步驟間的產物功能劃分，該技術主要分為兩個試驗部分：

第一部分，使用 “共生菌群” 固定二氧化碳，提高產量的同時，其產物蔗糖能夠作為異養菌種的飼料;

第二部分，基于改造菌種的發酵過程制造所需產品。

首先，通過表達藍藻相關的蔗糖合成酶類構建代謝通路，研究團隊設計了基于大腸桿菌與 C. necator 的共生系統從而提高蔗糖產量。

隨后，研究團隊針對 PHA 的生產工藝進行設計，通過組合不同的硫酯酶和 PHA 合成酶選擇性地改變產品組成，以便直接從二氧化碳中生產共聚物。此外，研究團隊還設計了 C. necator 使用二氧化碳生產 LCOs 的路徑，該化合物是一種植物生長促進劑。

圖丨基于工程化 C. necator 的代謝通路(來源：Metabolic Engineering)

通過比較數據發現，共生菌落系統所獲蔗糖產量是單獨 C. necator 培育系統產量的 2~3 倍;與野生型菌株產量相比則提高至 30 倍。研究者猜測，該結果可能是由于異養菌種的熱力學能被自養菌群有效利用導致的。

在第一部分試驗的最后，研究團隊利用共生菌落中的大腸桿菌成功制造出了紫羅蘭素和胡蘿卜素。這將為實現更長遠的生產目標打下基礎。

除此之外，經過通路改造，PHA 產量也進一步提高，根據產物組成的不同其產物細胞干重比由此前的個位數提升至 30~60%。而生產的 LCOs 滴度則為 1.4 mg/L，相當于其天然來源慢生根瘤菌的產量。研究團隊將所獲得 LCOs 應用于發芽種子和玉米植物，觀察到了各種生長參數的增加。

在研究過程中，基于 PHA 合成通路產生的游離脂肪酸吸引了研究團隊的注意。其價值在于，利用能夠表達不同酶類的改造菌種，將能夠合成特定的各種鏈長的脂肪酸分子。

而通過使用短鏈、中鏈、長鏈等不同的脂肪酸分子，Circe 將能夠分別模仿制造出不同類型與來源的脂肪分子，例如植物來源的可可脂、亞麻籽油抑或是動物來源的乳脂等等，然后用于配制成美味且對于氣候友好的食品。

這種能夠精確設計并制造的產物分子給予了 Circe 進軍食品業的信心。研究團隊表示，經過適當的設計改造，該類細菌具備在合適的生長條件下生產任何數量的各類產品。其潛在產品包括但不限于：各種鏈長的醇類、脂肪酸、烷烴、聚合物和氨基酸等。

“我們對于公司的設想是，按照市場的需要生產不同的脂肪。告訴我們你想要哪種脂肪，我們將設計微生物來制造那個分子。” 擔任公司首席執行官的 Shannon Nangle 說道。目前，該公司已針對代謝途徑和過程等技術申請專利。

總體上看，該項研究不僅證明了其改造菌種用于生產的多功能性，同時探索了自二氧化碳到最終產物的直鏈化生產。

當前階段，如何實現高效，低成本，可持續的糖原料供給，已經成為生物能源與生物煉制發展的主要瓶頸問題。

通過基因編輯和代謝工程，Circe 構建了更簡潔的代謝生產途徑。據介紹，該公司將首先推出可替代乳脂的甘油三酯(TAG)，另一個短期內的生產目標則是 PHA，用于制造可生物降解的塑料包裝、紡織品和個人護理成分等。

在未來，其共生菌落生產系統或將能夠以純粹 “自給自足” 的方式生產出更多的生物制品。

國內高校研究屢獲進展，大規模生產待考驗

在我國，基于 C. necator 菌種的自養發酵技術也受到了研究者的持續關注。

2018 年，來自天津大學化學工程與技術學院的宋浩等人，基于 C. necator H16 構建微生物電合成(MES)反應系統，以提高聚 - 3 - 羥基丁酸酯的產量。

2019 年，中國科學院天津工業生物技術研究所的畢昌昊團隊，構建了以 C. necator 菌合成脂肪酸的生物途徑，其研究獲得了中科院重點部署 “二氧化碳人工生物轉化” 項目的支持。2020 年，該團隊又通過改造菌種，以提高聚羥基丁酸酯的產量。

毋庸置疑的是，推廣并使用基于發酵技術的生物制品將有利于減少畜牧業、養殖業以及農業生產過程中的資源、土地和能源消耗。此外，“碳固定” 技術風頭正盛。無論是出于日益嚴峻的環境問題考慮，還是從全球各國紛紛推出的相關利好政策來看，這一領域都將變得更加火熱。

而對于消費者來說，現階段生物合成食品的風險尚不明確。不過，基于發酵合成的理論來看，該類食品能夠保證充足的蛋白質、營養成分和美妙風味，其在膽固醇、激素和抗生素等成分的控制方面也將存在明顯優勢。在未來，老年人、過敏人群以及素食主義者或將能夠根據需求選擇該類個性化商品。

在此之前，Circe 將首先致力于解決擴大生產規模的問題。

同大多數研究一樣，Circe 的發酵過程誕生于一個實驗室的燒瓶中，到目前為止，該流程的生產規模已經升級到容量為 10 升的發酵罐中。

對此，專注于生物催化與合成生物學方法研究的弈柯萊生物科技創始人羅煜博士表示，Circe 在從技術走向生產的過程中，反應系統的安全性、合理培養并控制大量的微生物及其代謝產物將成為重要課題。

由于 C. necator 的生產環境需要穩定、嚴格配比的二氧化碳、氫氣和空氣，而在裝置擴容后，由氫氣導致的爆炸風險將成為首個限制因素。

另外，發酵菌體能夠允許的存活密度和生長周期也是難點所在。雖然共生菌落系統表現出同時利于兩種菌體的優勢，但用于工業化生產之中，微生物的生長密度和存活期將涉及到成本問題。而野生型 C. necator 的生長周期本身較長。

最后，多個菌種協同生產雖然在技術上能夠實現，但隨之而來的問題還包括更復雜的中間產物，以及在代謝產物不斷積累的情況下能否實現連續化生產。包括后續可能會有更加復雜的分離純化步驟，這些都將與成本問題息息相關，也是目前該類技術在工業方面應用受限的主要原因。

不過，羅煜也表示，基于微生物發酵技術能夠直接合成與天然的動植物產品相同的分子，該技術在近年來屢獲突破。不管是在合成效率還是合成范圍方面都有可喜進展。此外，國家政策長期 “偏愛” 可持續發展技術企業，合成食品在符合相關法規和標準的要求之下，將具有很大的市場需求和發展空間。

“如果不能擴大規模，它就沒有什么價值。"Circe 的首席科學官 Marika Ziesack 表示，研究團隊的下一步計劃將是繼續 擴大反應，最終形成能夠與二氧化碳供應企業(例如各類高排放工廠)配合并直接飼養微生物的規模。

關鍵詞： 食用油 合成 二氧化碳 二氧化碳合成